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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

旧金山中央地铁华埠白兰站“交通大使”便利乘客******

　　中新网1月19日电 据美国《世界日报》报道，美国旧金山中央地铁华埠白兰站自去年11月19日运行以来，一直受到民众和媒体的关注。前往拍照打卡与乘坐体验的市民络绎不绝。为了保障乘客安全、方便、快捷乘坐地铁的“交通大使”们，发挥着不可或缺的桥梁和服务作用。

　　伍女士是负责组织培训与管理交通大使的志愿者。她表示，每天都有交通大使来维持华埠白兰站的乘车安全，重点是帮助华裔长者。因白兰站从地铁入口到月台乘车，从上到下约有九层楼高的距离。为维护乘客的安全、帮助乘客即时了解乘车信息，交通大使是不可或缺的岗位。

　　服务于白兰站的交通大使由华裔新老移民组成，他们表示，可以用自己的语言为社区服务，感到非常荣幸和有归属感。虽是在服务别人，但自己收获的愉悦是最大的。

　　另一名白兰站交通大使唐先生透露，因白兰站位居华埠，且直达湾景区与米慎湾等多数华人社区，因此到白兰站的乘客，90%是华裔长者。他们来到新的环境，有相同语言的人可以提供帮助，便不会觉得惊慌。

　　唐先生因可以讲流利的中文和英文，自中央地铁线2022年11月19日开始试运行以来，就担任交通局的“交通大使”，为不计其数的本地、外地以及国外游客担任向导和解说。他及时将地铁延误或是有误的乘坐信息传递给乘客，舒缓乘客紧张焦虑情绪，并将乘客的要求即时反馈给交通局，起到沟通乘客与交通局的桥梁作用。

　　前往乘坐地铁的刘婆婆说，十年前自己亲自投票，支持中央地铁的建设。现在看到它开通，很想来看看。一进地铁，便看到跟自己说一样语言的交通大使上前指路，感到很亲切，就不再害怕和担心自己搞不定怎么坐车了。

　　伍女士表示，其他站点也会有交通大使，但并不像白兰站这么多。因华埠是新侨老侨来集会或是采买日用品的地方。如一直保有交通大使的服务会让华埠站更安全卫生。让华裔社区居民开心出门，平安而归，是每个交通大使的心愿。(李怡)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）